1998
Se inicia la construcción del Edificio No. 6 del Campus I, que tiene cuatro plantas
Se realizan trabajos en la instalación de la Red Telefónica subterránea del Campus I
Se recibe la donación de un terreno de ocho manzanas para el Campus II, situado contiguo a la Escuela Militar Capitán General Gerardo Barrios, en Antiguo Cuscatlán
Se realizan modificaciones en el Edificio No. 3 del Campus I para adecuarlo al funcionamiento de la Escuela de Artes Aplicadas, y la Clínica de Atención Psicológica, y se construyen los talleres de la Escuela de Artes Aplicadas y el Laboratorio de Química de la Facultad de Agricultura e Investigación Agrícola
1999
Se concluye la construcción y adecuación de los espacios y adquisición de mobiliario para aulas y oficinas del Edificio No. 6
Durante este año se invirtió en la renovación de mobiliario y equipo para el área de enseñanza y el área administrativa
Se inicia la construcción y adecuación de la cuarta planta del Edificio No.6 para el funcionamiento de los Laboratorios de las siguientes Unidades Académicas: Escuela de Medicina, Escuela de Ingeniería Industrial y Facultad de Agricultura e Investigación Agrícola
2000
Se concluye la adecuación de los Laboratorios de la 4ª planta del Edificio No. 6
Se realizan obras adicionales para interconexión al Edificio No. 6 (adecuación eléctrica, informática y telefonía)
Durante el año se realizan inversiones para el área de enseñanza, administración, y equipo pequeño y herramienta para el correcto funcionamiento de la Universidad
2001
Se realizan reparaciones menores en los Edificios del Campus I a raíz de los terremotos de este año
Se inician los trabajos de terracería y urbanización en el Campus II
Se construye la bodega de equipo audiovisual aledaña al Edificio No. 1 de la Facultad de Economía
Se compran los Montacargas para ser utilizados en los Edificios 5 y 6
Se realizan gastos en instalaciones eléctricas en el Campus I
Se construye otra bodega y talleres de mantenimiento
Se realizan inversiones en mobiliario, equipo y herramientas en las áreas de enseñanza y administrativas
2002
Se hacen trabajos de adecuación para aumentar el número de estacionamientos
Se realizan adecuaciones para el funcionamiento del Aula Virtual en la 1ª planta del Edificio No.6
Se hacen trabajos de adecuación en áreas verdes y jardines del Campus I
Se inicia 2ª etapa del Campus II, con la construcción del Edificio de Jurisprudencia y Ciencias Sociales de cinco plantas
Área Académica Sub Área Docencia
Se desarrollaron diferentes capacitaciones en el área docente durante este período, con una inversión de más de $10,000.00 por año, lo cual provee una capacitación constante para los docentes de la Universidad
Se impartirá la capacitación al personal académico bajo el Programa de Actualización de Habilidades Docentes, desarrollado por el Instituto Tecnológico de Monterrey por medio de la Dirección de Educación Virtual
Sub Área Investigación y Proyección Social
Se realizaron inversiones para el desarrollo de proyectos orientados en esas áreas, incluyendo los costos administrativos de cada Unidad, dado que se tiene un área especifica para el Centro de Investigaciones en Ciencias y Humanidades y otra para la Dirección de Proyección Social
Sub Área Carreras y otros Programas Académicos y de Extensión Universitaria
Durante este periodo se crean las Maestrías siguientes: Maestría en Finanzas Empresariales, Maestría en Comunicación Organizacional, Maestría en Administración Pública. Siendo importante mencionar que para la Maestría en Administración Pública el primer año se adecua el local y luego el ICAP capacita a los docentes de acuerdo al Convenio
En otros Programas se han desarrollado los siguientes Diplomados:
Diplomado en Administración Aduanera
Diplomado en Administración Tributaria
Diplomado en Auditoria Gubernamental
Diplomado en Gerencia Municipal
Diplomado en Agro-negocios
Diplomado en Agro-ecoturismo
Diplomado en Agricultura Orgánica
Diplomado en Microbiología de Alimentos
Diplomado en Gestión Ambiental
Diplomado en Comunicación Organizacional
Diplomado en Periodismo Económico y Financiero
Diplomado en Periodismo Político y Electoral
Diplomado en Redacción Avanzada para Medios de Comunicación
Se desarrolla la revisión curricular de la Facultad de Economía
Programas para desarrollo integral de los alumnos como deportes, teatro, Coro Universitario, y otras actividades como Ferias, Exposiciones, Concurso de Talento, Semanas Culturales y Día del Estudiante
Sub Área Recursos Educacionales
Esta área comprende gastos para la compra de libros, en las diferentes áreas académicas
Sub Área Clúster
La Universidad ha desarrollado alianzas empresariales durante este periodo con: INCAE, ISDEM, PNC, Ministerio de Gobernación, Laboratorios Suizos, 3M, GRUPO Q, entre otros.